Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms