Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3550W4VSN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3550W4VSN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.7 ms