Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs4Q9Z1T2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thbs4Q9Z1T2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thbs4Q9Z1T2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms