Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cd97Q9Z0M6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd97Q9Z0M6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd97Q9Z0M6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd97Q9Z0M6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms