Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf15Q9Z0J7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf15Q9Z0J7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf15Q9Z0J7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms