Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srd5a3Q9WUP4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srd5a3Q9WUP4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Srd5a3Q9WUP4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srd5a3Q9WUP4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms