Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nrf1Q9WU00 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Nrf1Q9WU00 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nrf1Q9WU00 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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Nrf1Q9WU00 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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Nrf1Q9WU00 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Nrf1Q9WU00 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Nrf1Q9WU00 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrf1Q9WU00 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Nrf1Q9WU00 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Nrf1Q9WU00 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Nrf1Q9WU00 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Nrf1Q9WU00 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrf1Q9WU00 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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