Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv2Q9WTR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpv2Q9WTR1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms