Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NbnQ9R207 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NbnQ9R207 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NbnQ9R207 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms