Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sorbs3Q9R1Z8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs3Q9R1Z8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sorbs3Q9R1Z8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms