Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsjQ9R014 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsjQ9R014 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsjQ9R014 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms