Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d3cQ9QZS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh2d3cQ9QZS8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d3cQ9QZS8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms