Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf4Q9QZS2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf4Q9QZS2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf4Q9QZS2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf4Q9QZS2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms