Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trp53inp1Q9QXE4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trp53inp1Q9QXE4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms