Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms