Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reg3dQ9QUS9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reg3dQ9QUS9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg3dQ9QUS9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reg3dQ9QUS9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reg3dQ9QUS9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg3dQ9QUS9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg3dQ9QUS9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg3dQ9QUS9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Reg3dQ9QUS9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms