Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp3a41aQ9JMA7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms