Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL60

Gmeb1, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gmeb1Q9JL60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gmeb1Q9JL60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gmeb1Q9JL60 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gmeb1Q9JL60 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gmeb1Q9JL60 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gmeb1Q9JL60 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gmeb1Q9JL60 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms