Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Upk3aQ9JKX8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upk3aQ9JKX8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Upk3aQ9JKX8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms