Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip3Q9JJR9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip3Q9JJR9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrip3Q9JJR9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip3Q9JJR9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms