Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ercc6l2Q9JIM3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6l2Q9JIM3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6l2Q9JIM3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms