Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dclre1aQ9JIC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1aQ9JIC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1aQ9JIC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dclre1aQ9JIC3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms