Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird1Q9JI57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird1Q9JI57 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms