Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Rb1cc1Q9ESK9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Rb1cc1Q9ESK9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Rb1cc1Q9ESK9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Rb1cc1Q9ESK9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
Rb1cc1Q9ESK9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Rb1cc1Q9ESK9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms