Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms