Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk4Q9ERK0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ripk4Q9ERK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ripk4Q9ERK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms