Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lima1Q9ERG0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lima1Q9ERG0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lima1Q9ERG0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lima1Q9ERG0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lima1Q9ERG0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lima1Q9ERG0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lima1Q9ERG0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lima1Q9ERG0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms