Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tomm20Q9DCC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tomm20Q9DCC8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tomm20Q9DCC8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tomm20Q9DCC8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms