Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc97Q9DBT3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc97Q9DBT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc97Q9DBT3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms