Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnpy3Q9DAU1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnpy3Q9DAU1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnpy3Q9DAU1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cnpy3Q9DAU1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnpy3Q9DAU1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms