Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd8Q9DA37 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd8Q9DA37 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samd8Q9DA37 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms