Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph9Q9D9V4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph9Q9D9V4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph9Q9D9V4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph9Q9D9V4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms