Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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