Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlirpQ9D8T7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlirpQ9D8T7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlirpQ9D8T7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms