Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo2Q9D8S4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo2Q9D8S4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo2Q9D8S4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms