Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tube1Q9D6T1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tube1Q9D6T1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tube1Q9D6T1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tube1Q9D6T1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms