Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hspb11Q9D6H2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspb11Q9D6H2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hspb11Q9D6H2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hspb11Q9D6H2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hspb11Q9D6H2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hspb11Q9D6H2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hspb11Q9D6H2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hspb11Q9D6H2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hspb11Q9D6H2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hspb11Q9D6H2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hspb11Q9D6H2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms