Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rabl3Q9D4V7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rabl3Q9D4V7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rabl3Q9D4V7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms