Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpn3Q9D3W4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpn3Q9D3W4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpn3Q9D3W4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms