Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph14Q9D3W1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph14Q9D3W1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms