Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33aQ9D2N9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps33aQ9D2N9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33aQ9D2N9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms