Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q4

Dpm3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm3Q9D1Q4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpm3Q9D1Q4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dpm3Q9D1Q4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dpm3Q9D1Q4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpm3Q9D1Q4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpm3Q9D1Q4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpm3Q9D1Q4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpm3Q9D1Q4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpm3Q9D1Q4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpm3Q9D1Q4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms