Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl53Q9D1H8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mrpl53Q9D1H8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms