Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyc1Q9D0M3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyc1Q9D0M3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyc1Q9D0M3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyc1Q9D0M3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyc1Q9D0M3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyc1Q9D0M3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyc1Q9D0M3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyc1Q9D0M3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyc1Q9D0M3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms