Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2v1Q9CZY3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2v1Q9CZY3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2v1Q9CZY3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2v1Q9CZY3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2v1Q9CZY3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms