Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snf8Q9CZ28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snf8Q9CZ28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snf8Q9CZ28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snf8Q9CZ28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms