Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms