Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prelid3bQ9CYY7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prelid3bQ9CYY7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms