Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bud23Q9CY21 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bud23Q9CY21 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bud23Q9CY21 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bud23Q9CY21 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms