Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXG9

Phf19, PHD finger protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf19Q9CXG9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf19Q9CXG9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Phf19Q9CXG9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf19Q9CXG9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf19Q9CXG9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms