Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx47Q9CWX9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx47Q9CWX9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx47Q9CWX9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx47Q9CWX9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx47Q9CWX9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx47Q9CWX9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms